More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3789 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  89.26 
 
 
392 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3789  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
392 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  59.32 
 
 
397 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  42.86 
 
 
380 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  43.09 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  43.09 
 
 
380 aa  273  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0789  glycosyl transferase group 1  42.82 
 
 
390 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  21.68 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.46 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.69 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  27.1 
 
 
638 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
394 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0770  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  23.22 
 
 
376 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
367 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  26.4 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  25.88 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0473  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
417 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
400 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6702  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
375 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
391 aa  59.7  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05650  glycosyltransferase  30.34 
 
 
357 aa  59.7  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.520529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
435 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  31.79 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
422 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.44 
 
 
501 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.19 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1496  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  33.18 
 
 
392 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
743 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.81 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
384 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
639 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  22.81 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
360 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  25 
 
 
444 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.94 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  24.7 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.6 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
380 aa  56.6  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  33.58 
 
 
385 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
373 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
415 aa  56.2  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  25.95 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
361 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  38.53 
 
 
440 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
669 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.98 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.98 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  29.8 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.98 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.88 
 
 
365 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
822 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0361  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
374 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>