More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1496 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1496  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
339 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
704 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  31.03 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  26.64 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1209  putative glycosyltransferase  34.44 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  26.74 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  25.61 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
400 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
385 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
391 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  22.56 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  29.27 
 
 
816 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
819 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.57 
 
 
769 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
374 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  48.61 
 
 
382 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
358 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
816 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  42.06 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
421 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
384 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.08 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
403 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  23.04 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
1080 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
435 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  27.39 
 
 
564 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
358 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
360 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
383 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
417 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
358 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  34.09 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  27.64 
 
 
415 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
370 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
387 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  20.22 
 
 
359 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
368 aa  59.7  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
378 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
800 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
394 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
425 aa  59.3  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  21.5 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.64 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
401 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
380 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  30.98 
 
 
425 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
812 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  23.93 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3789  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>