More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1579 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 358 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  38.07 
 
 		 388 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  39.22 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  42.41 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  38.77 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  40.82 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  37.53 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  38.48 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  37.66 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.3 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  39.3 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.57 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.3 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  42.07 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  31.25 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 		 770 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  20.9 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 384 aa  96.3  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  29.77 
 
 		 383 aa  92.8  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  34.33 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 408 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 457 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 382 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.75 
 
 		 431 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.08 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  38.18 
 
 		 388 aa  85.9  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.19 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  30.19 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.03 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0725  glycosyl transferase, group 1  20.42 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  29.21 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  32.34 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  37.43 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 748 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>