More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0789 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0789  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
390 aa  779    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  47.3 
 
 
380 aa  345  6e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  47.24 
 
 
380 aa  322  5e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  46.98 
 
 
380 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3789  glycosyl transferase group 1  42.82 
 
 
392 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  42.47 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.1 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 
446 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.88 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
669 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.63 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.63 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.63 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  19.81 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.5 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  29.31 
 
 
416 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
476 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.29 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
438 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
438 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.24 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
850 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0473  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
678 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.47 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
383 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
808 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.78 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.51 
 
 
420 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
408 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 
437 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
357 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.65 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
373 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
392 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
452 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
420 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
392 aa  60.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
379 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  27.24 
 
 
367 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
364 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  22.02 
 
 
391 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
1267 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
431 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5603  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
403 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  28.11 
 
 
395 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
417 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4199  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 
368 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0361  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
354 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
383 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>