88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1530 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 380 aa  773    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  79.2 
 
 		 380 aa  594  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  53.97 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  44.39 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  43.77 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 		 393 aa  278  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  43.54 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  40.37 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 		 364 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 		 363 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  39.17 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  33.85 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  26.76 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2942  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0055  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.557703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0157  hypothetical protein  44.23 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  23.61 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  25.95 
 
 		 440 aa  50.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  24.83 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  25.48 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  28.45 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  29.92 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0789  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  29.92 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  26.14 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2804  hypothetical protein  28.67 
 
 		 327 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  21.58 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  31.54 
 
 		 420 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  18.26 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.47 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3789  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  29.92 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 478 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  25.25 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  29.81 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  20.75 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  22.8 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.59 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.68 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  29.68 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.68 
 
 		 388 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  23.05 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>