72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1403 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 393 aa  798    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  42.32 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 		 380 aa  278  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  41.56 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  43.6 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  39.34 
 
 		 378 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  40.36 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  44.31 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  37.99 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 360 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  28.37 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  25.53 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1408  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 885 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  24.17 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  25.46 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  21.47 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  27.27 
 
 		 596 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  31.97 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  22.6 
 
 		 420 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 772 aa  47  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  29.13 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 343 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0789  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 397 aa  46.6  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.85 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  25.31 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 831 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  25.73 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  24.52 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.81 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 1229 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0215  glycosyltransferase  21.27 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  23 
 
 		 488 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  25.5 
 
 		 501 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  28.78 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 370 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  23.85 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 370 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 435 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0157  hypothetical protein  34.55 
 
 		 357 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>