More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1408 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1408  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 354 aa  727    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1961  glycosyl transferase group 1  39 
 
 		 350 aa  222  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0891  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1147  glycosyltransferase  24.28 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000216954  hitchhiker  0.0000000335668 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1232 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  42.42 
 
 		 1028 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0075  hypothetical protein  24.63 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 746 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  30.5 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  43.4 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4642  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 770 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.01 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.01 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 304 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.01 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  29.56 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 655 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 403 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 396 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 		 370 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  26.27 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 398 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  24.55 
 
 		 422 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  30.13 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0110  hypothetical protein  26.44 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.769196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0889  glycosyl transferase group 1  45.16 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.75 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.06 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.7 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  26.43 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 1089 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  26.47 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  30.13 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 507 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1374  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 615 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0108808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 374 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  28.66 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  29.38 
 
 		 466 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>