More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1147 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1147  glycosyltransferase  100 
 
 
350 aa  713    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000216954  hitchhiker  0.0000000335668 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1061  glycosyltransferase  49.71 
 
 
350 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3220  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
364 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2676  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
372 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00158142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4642  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0251  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
406 aa  113  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3880  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
366 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
366 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
1152 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
1152 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1374  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
615 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0108808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  23.47 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0891  glycosyl transferase group 1  21.46 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  21.13 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.56 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.2 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.48 
 
 
385 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.32 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  22.32 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.32 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.73 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1400  glycosyl transferase, group 1  21.75 
 
 
571 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0889  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
440 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  22.64 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
435 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  24.53 
 
 
375 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
452 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.7 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  20.91 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
458 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
383 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  45 
 
 
678 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  20.4 
 
 
384 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  22.92 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
406 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  20.85 
 
 
426 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  20.43 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
669 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  20.4 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  20.4 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  31.13 
 
 
1232 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  20.4 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  23.5 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21.15 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  20.55 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  21.62 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
1261 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2509  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
406 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  20.37 
 
 
412 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
382 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.46 
 
 
388 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  21.83 
 
 
414 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  18.63 
 
 
361 aa  59.7  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
374 aa  59.3  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
392 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
371 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  25.93 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21.56 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>