More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4642 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4642  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
364 aa  722    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1061  glycosyltransferase  30 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3220  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1147  glycosyltransferase  27.86 
 
 
350 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000216954  hitchhiker  0.0000000335668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2676  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00158142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3880  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0251  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
406 aa  106  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000777332  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
383 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
366 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1374  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
615 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0108808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0889  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1400  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
571 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0891  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
332 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
446 aa  79.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.64 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  32.67 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  41 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  23.98 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  24.27 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
579 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  26.27 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  31.42 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  22.57 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  31.56 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  20.17 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 
355 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  42.05 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  31.43 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  31.43 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.06 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  42.57 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  31.56 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  29.51 
 
 
716 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  31.56 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  23.48 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
420 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  30.89 
 
 
722 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  19.92 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  23.18 
 
 
1152 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  23.18 
 
 
1152 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
394 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
408 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
408 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
367 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
456 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.63 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  21.32 
 
 
364 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
370 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  34.31 
 
 
419 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>