More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4432 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
370 aa  752    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  76.86 
 
 
373 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.31 
 
 
373 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  75.76 
 
 
373 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  75.48 
 
 
370 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  72.13 
 
 
371 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  72.13 
 
 
371 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  67.6 
 
 
366 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  61.54 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  55.37 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 
410 aa  272  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  44.35 
 
 
399 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  44.35 
 
 
390 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
373 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
378 aa  162  7e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5824  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
383 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  32 
 
 
381 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
416 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
388 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
388 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
388 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.87 
 
 
377 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
427 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.8 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  24.8 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
380 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  28.68 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.53 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.56 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
380 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 
381 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
393 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
402 aa  115  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  29.43 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.27 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.27 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  30.7 
 
 
393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  26.77 
 
 
381 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
393 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
377 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  29.3 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  25.85 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
655 aa  110  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
381 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
381 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
375 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.99 
 
 
385 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
385 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
378 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.37 
 
 
400 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  25.91 
 
 
382 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.91 
 
 
382 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
385 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
387 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  28.07 
 
 
372 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.84 
 
 
373 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
378 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
385 aa  106  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
377 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
378 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
370 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
404 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 
404 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
375 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
382 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  27.39 
 
 
381 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1603  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
381 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
381 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
405 aa  103  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
810 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
377 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
458 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
390 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
406 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  23.85 
 
 
372 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
387 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
426 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
385 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  26.32 
 
 
382 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
373 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
370 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.78 
 
 
393 aa  99.8  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
434 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
507 aa  99.8  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
394 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  25.26 
 
 
377 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  25.79 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
406 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>