More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3883 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 399 aa  789    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 390 aa  770    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  47.66 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  48.08 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  44.9 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  44.63 
 
 		 373 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  43.99 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.99 
 
 		 373 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  44.26 
 
 		 370 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  44.02 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  43.82 
 
 		 366 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  43.01 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 379 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 387 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 377 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 378 aa  127  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  35.13 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  37.16 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  35.89 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.05 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  34.42 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 820 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  31.79 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  29.22 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.05 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  30.17 
 
 		 679 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 375 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.98 
 
 		 380 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.79 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  25.79 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 413 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  28.7 
 
 		 385 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  28.92 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  32.3 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 		 416 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  35.94 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  29.72 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  28.04 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.05 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  27.08 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  34.89 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  27.08 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  29.81 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  26.44 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.83 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>