More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0336 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 399 aa  822    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0857  a-glycosyltransferase  31.83 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 821 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 821 aa  87  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  26.24 
 
 		 820 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  30.53 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 818 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 822 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 819 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  31.29 
 
 		 820 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.58 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  27.68 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.65 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 821 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 821 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 821 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.01 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 		 857 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  21.6 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  32.61 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  32 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 828 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  23.82 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.29 
 
 		 856 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.29 
 
 		 856 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  31.29 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.29 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.29 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  31.29 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  33.33 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 689 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.43 
 
 		 745 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  27.38 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.47 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1433  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  27.95 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  26.36 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  21.48 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>