More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2055 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2055  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 370 aa  721    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4687  glycosyl transferase group 1  63.46 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1218  glycosyl transferase, group 1  61.98 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6665  glycosyl transferase group 1  58.33 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  38.54 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  36.01 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  36.8 
 
 		 422 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 		 382 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0060  glycosyltransferase  41.46 
 
 		 174 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.71 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.23 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.7 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15390  glycosyltransferase  34.12 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  37.7 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.72 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.72 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.72 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.97 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  29.31 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.26 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  32.68 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.4 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  32.62 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.38 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1983  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.55 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>