16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0060 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0060  glycosyltransferase  100 
 
 		 174 aa  347  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 391 aa  337  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  88.02 
 
 		 391 aa  278  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  81.4 
 
 		 404 aa  264  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  64.91 
 
 		 408 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  57.93 
 
 		 381 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  53.12 
 
 		 377 aa  167  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  47.71 
 
 		 389 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  48.41 
 
 		 400 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  44.51 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  42.6 
 
 		 390 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  44.19 
 
 		 391 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2055  glycosyl transferase group 1  40.34 
 
 		 370 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4687  glycosyl transferase group 1  38.51 
 
 		 367 aa  84.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6665  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 433 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1218  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 		 364 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>