More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2072 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  100 
 
 
375 aa  743    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  79.14 
 
 
375 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  72.58 
 
 
388 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  64.61 
 
 
388 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  67.3 
 
 
379 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  65.57 
 
 
401 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  61.21 
 
 
386 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  59.36 
 
 
391 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  57.99 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1788  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  59.89 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  57.95 
 
 
385 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  57.53 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  56.44 
 
 
377 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  55.76 
 
 
402 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  57.33 
 
 
404 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  57.61 
 
 
381 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  56.71 
 
 
388 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  51.58 
 
 
400 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  56.68 
 
 
375 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  55.35 
 
 
435 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1983  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  57.3 
 
 
390 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  51.87 
 
 
384 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  52.67 
 
 
376 aa  362  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  53.95 
 
 
371 aa  352  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  51.61 
 
 
374 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  51.61 
 
 
374 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  51.61 
 
 
374 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  49.07 
 
 
378 aa  332  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1923  glycosyl transferase group 1  52.28 
 
 
374 aa  332  8e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2291  glycosyl transferase group 1  49.46 
 
 
374 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.85 
 
 
396 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15390  glycosyltransferase  38.68 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.95 
 
 
382 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  41.34 
 
 
385 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  35.48 
 
 
382 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  41.76 
 
 
379 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  42.93 
 
 
375 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  41.22 
 
 
379 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.68 
 
 
382 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  42.06 
 
 
379 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.72 
 
 
775 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4807  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.71 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
370 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
370 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.59 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.56 
 
 
367 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.33 
 
 
374 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.12 
 
 
381 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0448  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
408 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
384 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
423 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
415 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
395 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
391 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
376 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
397 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
398 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
384 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
411 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
410 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
391 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
404 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
421 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
353 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
367 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
370 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.51 
 
 
388 aa  95.9  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
446 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
452 aa  93.2  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
391 aa  93.2  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05020  glycosyltransferase  30.85 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
403 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
373 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.8 
 
 
745 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 
471 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
392 aa  89.7  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
457 aa  89.7  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  30.61 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
402 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>