216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2887 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  100 
 
 
394 aa  805    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  47.24 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  35.49 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
394 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 
387 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  30.9 
 
 
389 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
385 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  36.16 
 
 
642 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
410 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
418 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  32.05 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  31.25 
 
 
404 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
409 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
382 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
413 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1887  mannosyltransferase  30.05 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
366 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
362 aa  62.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  31.97 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  25.54 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  31.97 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  31.97 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  25.54 
 
 
372 aa  60.1  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  31.29 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.78 
 
 
375 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.33 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
435 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
374 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  23.66 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
371 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  34.41 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
375 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
355 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0179  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.203748  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  20.53 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
364 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
456 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  23.21 
 
 
375 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
408 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
360 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  22.56 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  23.45 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
434 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
394 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
817 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  23.45 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
1770 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
387 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
387 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
402 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
437 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  23.21 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0755  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>