155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1853 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
385 aa  775    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  75.39 
 
 
387 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  47.41 
 
 
642 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
394 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
393 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  30.59 
 
 
389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  35.38 
 
 
404 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  34.06 
 
 
394 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
418 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  41.1 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
410 aa  163  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  35.71 
 
 
391 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
409 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
409 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.62 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
416 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
376 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  21.37 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
384 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
458 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3093  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
467 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
418 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  21.95 
 
 
375 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.49 
 
 
369 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
380 aa  52.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
361 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  32.09 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
440 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  29.13 
 
 
1119 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  24.65 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  23.43 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  25.71 
 
 
379 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  21.82 
 
 
355 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
400 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
368 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
409 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  22.93 
 
 
405 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
398 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.94 
 
 
406 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
382 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
784 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  21.12 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0179  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.203748  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
419 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0755  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.68 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  23.59 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
930 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  21.97 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  20.33 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
349 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  21.15 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
398 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>