More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0755 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0755  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 344 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1108  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1302  hypothetical protein  31.25 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1259  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.239983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 1915 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  28.35 
 
 		 1635 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  29.45 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  29.52 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 1241 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 770 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  28.9 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  25.73 
 
 		 460 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 1241 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  26.21 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 1229 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  29.75 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1232 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  29.75 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  29.75 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  29.75 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  29.75 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 393 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 838 aa  56.6  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  28.15 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 831 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 459 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 1089 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3586  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3659  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 434 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 433 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 456 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 426 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 442 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  26.88 
 
 		 642 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 417 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 456 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 846 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 373 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  24.46 
 
 		 1219 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  28.08 
 
 		 846 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 		 850 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  30.77 
 
 		 364 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>