34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0981 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0981  glycosyl transferase WboA  100 
 
 		 410 aa  855    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3130  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 765 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2123  hypothetical protein  17.58 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0336198  normal  0.0777783 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 402 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  21.86 
 
 		 364 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  21.82 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  21.98 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  20.88 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0275  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 		 850 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  20.19 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  22.55 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  20.12 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  22.17 
 
 		 1635 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  20.61 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  23.46 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 		 459 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1364  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>