More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0510 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
347 aa  727    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  45.38 
 
 
348 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0509  glycosyl transferase group 1  45.71 
 
 
349 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  42.82 
 
 
344 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  37.46 
 
 
356 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2517  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0975  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
356 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
370 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
366 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
400 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
361 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
408 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
384 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
360 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
357 aa  109  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
393 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
372 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
381 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
364 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
377 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
366 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
382 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  29.51 
 
 
430 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
369 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
343 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
361 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
371 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
355 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
387 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
387 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
386 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  29.74 
 
 
419 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
373 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
372 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.15 
 
 
353 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
431 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
364 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  26.04 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
524 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.59 
 
 
375 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
394 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
394 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.68 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
395 aa  96.3  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
378 aa  96.3  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.34 
 
 
351 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
420 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
376 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
380 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
428 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  25 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
374 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  21.24 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
672 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
434 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
375 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  34.04 
 
 
1219 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  27.24 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.58 
 
 
815 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
371 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  28.38 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01924  hypothetical protein  28.14 
 
 
260 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  28.77 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
437 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
471 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  28.77 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
386 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  24.91 
 
 
380 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
850 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>