More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2170 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  99.45 
 
 
366 aa  712    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
366 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  89.89 
 
 
366 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  56.07 
 
 
383 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  53.41 
 
 
368 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  51.56 
 
 
371 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  44.54 
 
 
386 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  44.01 
 
 
386 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  39.28 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  38.35 
 
 
388 aa  212  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 
368 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  42.77 
 
 
368 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  42.24 
 
 
378 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  45.77 
 
 
377 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 
371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 
371 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
369 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 
374 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  41.16 
 
 
386 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  37.92 
 
 
377 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  44.04 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  20.87 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  20 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.28 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  35.58 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  34.38 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  36 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36.52 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
349 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.04 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.93 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  28.24 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  43.3 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
394 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  48.08 
 
 
418 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  43.14 
 
 
304 aa  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
381 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
366 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  30.91 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
406 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.82 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.78 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  25.17 
 
 
356 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.3 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  45.36 
 
 
638 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
435 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>