More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3264 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
369 aa  758    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  40.33 
 
 
382 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  39.67 
 
 
375 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 
388 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
371 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 
371 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 
371 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
386 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
378 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
386 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
377 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
366 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  32.24 
 
 
366 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
368 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
368 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
368 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
383 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.93 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  24.9 
 
 
419 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
369 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  24.66 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  23.16 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
471 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
416 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
400 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
322 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
414 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  32.29 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
414 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
414 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
367 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  21.97 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
371 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
383 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
353 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3586  glycosyl transferase, group 1  39.76 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
822 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3659  glycosyl transferase, group 1  39.76 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3591  glycosyl transferase, group 1  39.76 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  27.17 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21660  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00485243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.25 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
748 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
428 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
1229 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.63 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
435 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
535 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
396 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
1243 aa  56.6  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
393 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.67 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  21.22 
 
 
351 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  23.62 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  24.42 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  19.57 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  44.62 
 
 
1241 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
438 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>