More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1268 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
386 aa  737    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  80.05 
 
 
378 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  68.42 
 
 
368 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  67.87 
 
 
368 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  66.4 
 
 
377 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  55.08 
 
 
386 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  53.78 
 
 
386 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  43.49 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  42.93 
 
 
366 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  42.39 
 
 
366 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
383 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  41.26 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  39.7 
 
 
371 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 
375 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 
382 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  42.63 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  39.37 
 
 
371 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  41.49 
 
 
374 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  40.52 
 
 
377 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.38 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.65 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.21 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.27 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.21 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
471 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.74 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.99 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  39.5 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
355 aa  60.8  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
421 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.5 
 
 
423 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.7 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  28.21 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  42.55 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.06 
 
 
377 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
395 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.44 
 
 
401 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
366 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
414 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.46 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  21.8 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.09 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.09 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.09 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
422 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
377 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  25.51 
 
 
404 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
361 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  35.04 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
369 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 
426 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
464 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
403 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.71 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  39.19 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  30.43 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  30.21 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.89 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  37.89 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
443 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
415 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 
401 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
810 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  20.71 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
397 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40.23 
 
 
370 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>