More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0508 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 378 aa  728    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  80.05 
 
 		 386 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  68.06 
 
 		 368 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  68.06 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  65.94 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  55.92 
 
 		 386 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  53.87 
 
 		 386 aa  325  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  43.34 
 
 		 366 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  42.24 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  41.95 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  40.73 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  40.06 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  40.77 
 
 		 371 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  40.86 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  40.6 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  40.97 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.09 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  44.57 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.76 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  40.34 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.46 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.67 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.45 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 426 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 418 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 353 aa  52.8  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 381 aa  52.8  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36.11 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0612  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.39 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 		 672 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  35.79 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  29.41 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  40.45 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  38.04 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  32.95 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.53 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.32 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  38.04 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  24.2 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>