226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0248 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 368 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  95.92 
 
 		 368 aa  616  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  68.06 
 
 		 378 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  66.48 
 
 		 377 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  69.25 
 
 		 386 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  51.79 
 
 		 386 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  52.34 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  43.06 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  42.78 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  42.25 
 
 		 383 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  41.94 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  42.15 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  37.85 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  40.76 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  26.54 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.18 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.67 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  38.74 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.27 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.27 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1233  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.979929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1395  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.157053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  39.6 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1174  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 		 365 aa  52.8  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.06 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  22.35 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  30.43 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 1264 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.96 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.86 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.23 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  28.52 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 		 425 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  20.92 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 393 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  38.82 
 
 		 383 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.79 
 
 		 404 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.41 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  40.54 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.02 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  37.93 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  35.11 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  29.86 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  41.57 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  44.12 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1587  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  41.54 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 535 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.03 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>