More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0518 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  100 
 
 		 366 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  99.45 
 
 		 366 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  89.34 
 
 		 366 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  56.07 
 
 		 383 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  51.56 
 
 		 371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  53.12 
 
 		 368 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  43.98 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  43.45 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 		 375 aa  215  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  42.46 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  42.78 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  40.73 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  44.65 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 371 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  40.85 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  37.31 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  44.04 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  20.87 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.28 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  34.38 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  35.58 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  36 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36.52 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  43.3 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.93 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.7 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  28.24 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  48.08 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  43.14 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  30.91 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  45.36 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  25.17 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.78 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.3 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>