More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1687 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 375 aa  762    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  94.91 
 
 		 388 aa  721    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  47.28 
 
 		 382 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  47.24 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  49.3 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  46.58 
 
 		 374 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  47.14 
 
 		 377 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  39.67 
 
 		 369 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  39.28 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  39.5 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  39.55 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 		 371 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  37.19 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 		 386 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 368 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  39.8 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 		 386 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  27.54 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  25.62 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.3 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  25.08 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.14 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0349  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 		 1043 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126249  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.61 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 850 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21660  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00485243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.45 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  21.34 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  27.23 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.68 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30.25 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.68 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.45 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  28.41 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  23.4 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  22.16 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  27.11 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  27.11 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 477 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>