More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2534 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  787    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  94.91 
 
 
375 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  47.61 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  48.65 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  49.45 
 
 
371 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  46.92 
 
 
374 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  47.87 
 
 
377 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 
369 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  38.35 
 
 
366 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  38.64 
 
 
366 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  38.87 
 
 
366 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 
371 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
386 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
386 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
368 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 
368 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
368 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  40.33 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
386 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.49 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  27.12 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  24.39 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  25.62 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.48 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.25 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
385 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.85 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  22.36 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
371 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
359 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.72 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.51 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0349  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 
1043 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126249  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
689 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.03 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  36.19 
 
 
340 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.33 
 
 
381 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  26.13 
 
 
350 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
370 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30.77 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
434 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
346 aa  60.1  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
850 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  29.92 
 
 
361 aa  59.7  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
1241 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
408 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21660  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00485243  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  27.5 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>