More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0435 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  87.31 
 
 
386 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
386 aa  741    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  55.92 
 
 
378 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  52.62 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  54.01 
 
 
377 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  52.34 
 
 
368 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  54.28 
 
 
386 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  44.01 
 
 
366 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  43.45 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  43.65 
 
 
368 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 
383 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  43.61 
 
 
366 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
371 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  40.5 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
388 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 
375 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
369 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 
374 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  40.41 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
356 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.61 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.84 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
364 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
361 aa  63.5  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.66 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
401 aa  62.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  38.66 
 
 
362 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  29.41 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
420 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
369 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
375 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.47 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.03 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
371 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 
416 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
378 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.04 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.33 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.38 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
535 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  31.34 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.95 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
382 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
370 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
417 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
360 aa  53.5  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
392 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
378 aa  53.5  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 
358 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  29.57 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
464 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.41 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  39.51 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.47 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1228  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000548043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
375 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3517  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
329 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.33 
 
 
376 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
366 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>