210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0194 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
368 aa  714    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  95.92 
 
 
368 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  68.06 
 
 
378 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  67.04 
 
 
377 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  52.62 
 
 
386 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  68.66 
 
 
386 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  52.33 
 
 
386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  42.78 
 
 
366 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  42.5 
 
 
366 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  41.41 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  41.67 
 
 
366 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  42.24 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
371 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
388 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
382 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  41.16 
 
 
371 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 
371 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  39.17 
 
 
374 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  39.67 
 
 
377 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  26.54 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.91 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 
471 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.77 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
362 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
370 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  37.84 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.03 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.18 
 
 
402 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  22.93 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
389 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
435 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  41.11 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.68 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 
419 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1233  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
388 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.979929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.68 
 
 
379 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1395  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
366 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.157053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  30.04 
 
 
379 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.63 
 
 
401 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.95 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.99 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
378 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
424 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
375 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  29.29 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
425 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
400 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
416 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
384 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
350 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
1264 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  38.82 
 
 
383 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  30.43 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  30.03 
 
 
638 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 
371 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  34.74 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  24.9 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  44.12 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1587  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1174  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.73 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 
439 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 
439 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
424 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.68 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  21.56 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  39.64 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>