More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1174 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1395  glycosyl transferase group 1  94.78 
 
 
366 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.157053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1233  glycosyl transferase group 1  94.51 
 
 
388 aa  687    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.979929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1174  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
364 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5108  glycosyl transferase group 1  67.04 
 
 
364 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0573721  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0204  glycosyl transferase group 1  41.62 
 
 
351 aa  242  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0147  glycosyl transferase group 1  40.78 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3365  glycosyl transferase group 1  42.98 
 
 
380 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178378  normal  0.0354182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0723  glycosyl transferase group 1  41.5 
 
 
363 aa  233  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0483  glycosyl transferase, group 1  43.89 
 
 
394 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0979566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4444  glycosyl transferase group 1  39.94 
 
 
378 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26620  glycosyltransferase  37.4 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0288  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 
351 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0266456  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19770  glycosyltransferase  38.75 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
365 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
359 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  34.16 
 
 
364 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
355 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  32.87 
 
 
357 aa  156  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
358 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
363 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0258  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
351 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
368 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
355 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5160  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
352 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
854 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2824  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
352 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  33.33 
 
 
340 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
386 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3902  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
342 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
360 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
336 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
344 aa  136  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1918  UDP-glucose:tetrahydrobiopterin glucosyltransferase  34.73 
 
 
359 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
353 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  29.94 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
367 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  28.61 
 
 
458 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
349 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0705  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
363 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.08 
 
 
354 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
354 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
349 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
354 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
354 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
354 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
354 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
354 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
354 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
374 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
354 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
354 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
362 aa  123  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
354 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
354 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  29.81 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
364 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
365 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1042  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
339 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0199  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3683  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4060  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586915  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  30.56 
 
 
354 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2085  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  30.85 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 
400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.59 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0142  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224106  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.39 
 
 
354 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
355 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>