More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3365 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3365  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
380 aa  754    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178378  normal  0.0354182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1233  glycosyl transferase group 1  43.99 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.979929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1395  glycosyl transferase group 1  44.08 
 
 
366 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.157053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0483  glycosyl transferase, group 1  43.77 
 
 
394 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0979566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1174  glycosyl transferase group 1  42.98 
 
 
364 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5108  glycosyl transferase group 1  43.36 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0573721  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0723  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4444  glycosyl transferase group 1  41.32 
 
 
378 aa  232  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26620  glycosyltransferase  41.1 
 
 
374 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0204  glycosyl transferase group 1  41.69 
 
 
351 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0147  glycosyl transferase group 1  40.23 
 
 
351 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0288  glycosyl transferase group 1  43.45 
 
 
351 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0266456  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19770  glycosyltransferase  38.36 
 
 
375 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
367 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
359 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
363 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
368 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  31.95 
 
 
351 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
362 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2085  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
346 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
365 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  31.87 
 
 
364 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  28.89 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5160  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
354 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  28.91 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0258  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.57 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.82 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
354 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.21 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3373  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000273398  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  33.57 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.21 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.21 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.21 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.21 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.21 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
354 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
355 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
355 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
373 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  37 
 
 
400 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
365 aa  112  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0142  glycosyl transferase group 1  43.15 
 
 
346 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224106  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  37 
 
 
354 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0545  glycosyl transferase group 1  42.16 
 
 
337 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  36.4 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0199  glycosyl transferase group 1  43.15 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31842 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  37 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  36.4 
 
 
354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
355 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
354 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3902  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
342 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  34.21 
 
 
360 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  35.53 
 
 
354 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
354 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
353 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  35.53 
 
 
354 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.45 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.45 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  33.45 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1033  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.45 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.45 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.45 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.45 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
354 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
354 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
354 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
354 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.86 
 
 
354 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
349 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>