More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3902 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3902  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
342 aa  704    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2759  glycosyl transferase group 1  41.69 
 
 
348 aa  272  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0642938  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
359 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
365 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  32.48 
 
 
357 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
363 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  33.43 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
373 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
349 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
365 aa  186  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1042  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
354 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
365 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
354 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  32.48 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
356 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  35.13 
 
 
361 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3260  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
364 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.85 
 
 
376 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.66 
 
 
354 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
854 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
364 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
355 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
408 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
354 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
354 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  31.79 
 
 
355 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
354 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
417 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
354 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
366 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5160  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  32.37 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0199  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
354 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0142  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224106  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
364 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
355 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
354 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
336 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
374 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
354 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 
400 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.7 
 
 
354 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 
354 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 
354 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
354 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
370 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
355 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
344 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
354 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
354 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
354 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
354 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
354 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  32.28 
 
 
360 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
376 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
354 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
354 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
354 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  31.07 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  31.52 
 
 
354 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
379 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0283  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
346 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
362 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  30.55 
 
 
354 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>