More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0201 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  100 
 
 
356 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
387 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
367 aa  86.3  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  26.73 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  26.59 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
390 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1026  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5412  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.71 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.26 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  20.99 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.01 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
639 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  21.05 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0694  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  20.42 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  27.82 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  23.95 
 
 
964 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1689  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
381 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
395 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
394 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
406 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
364 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
400 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
390 aa  62.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.32 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.87 
 
 
459 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
383 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  27.41 
 
 
365 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.87 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0292  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  25.17 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.1 
 
 
419 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13720  glycosyltransferase  30.43 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3396  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
414 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  21.86 
 
 
358 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  21.37 
 
 
391 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  26.51 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
374 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
373 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
355 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.29 
 
 
396 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  25.89 
 
 
343 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
368 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  25.89 
 
 
343 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
381 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  25.42 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
402 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
689 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
396 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
365 aa  59.3  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  26 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3264  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  21.97 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>