More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1587 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1587  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
418 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.12 
 
 
381 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
381 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
435 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.36 
 
 
351 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
434 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
408 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
376 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
395 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
364 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
354 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
456 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
367 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
340 aa  58.9  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6299  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
385 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
371 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
380 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  31.93 
 
 
426 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
456 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
357 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
383 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
371 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
383 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
381 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
379 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
810 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
373 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4074  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
339 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.545411 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
367 aa  55.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  28.07 
 
 
374 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  27.18 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
434 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
366 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
372 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
366 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  27.18 
 
 
337 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
358 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.3 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
392 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
399 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
370 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
399 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.05 
 
 
369 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
371 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
400 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
378 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
403 aa  52.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  36.7 
 
 
372 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
377 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  36.7 
 
 
372 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
426 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1694  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
363 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
387 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
387 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
355 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
346 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.75 
 
 
370 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
381 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
390 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
378 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
394 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
381 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.5 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
390 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
382 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
378 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
425 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  21.51 
 
 
394 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
362 aa  50.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
394 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
377 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
369 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
374 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
375 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
375 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
443 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  23.37 
 
 
346 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
395 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
346 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.75 
 
 
379 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
370 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
423 aa  48.9  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
403 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
370 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
362 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
388 aa  48.9  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
399 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
422 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
838 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
394 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  27.74 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>