More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2429 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  89.34 
 
 
366 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
366 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  89.89 
 
 
366 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3889  glycosyl transferase group 1  55.78 
 
 
383 aa  358  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0066878  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  53.09 
 
 
368 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  50.28 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0435  glycosyl transferase group 1  43.61 
 
 
386 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1687  glycosyl transferase group 1  39.5 
 
 
375 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2534  glycosyl transferase group 1  38.87 
 
 
388 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000721203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0508  glycosyl transferase group 1  43.34 
 
 
378 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3220  glycosyl transferase group 1  39.45 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0248  glycosyl transferase group 1  41.94 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.710789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0194  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276092  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1319  glycosyl transferase group 1  45.77 
 
 
377 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1123  glycosyl transferase group 1  39.57 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1107  glycosyl transferase group 1  39.17 
 
 
371 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134204  normal  0.271912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1192  glycosyl transferase group 1  39.76 
 
 
374 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.472741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3264  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
369 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1268  glycosyl transferase group 1  41.77 
 
 
386 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521114  normal  0.110318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1064  glycosyl transferase, group 1  38.48 
 
 
377 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  29.56 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  38 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.09 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  43.43 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0290  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.686096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.15 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
376 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  28.83 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  41.49 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
381 aa  63.5  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  20.66 
 
 
369 aa  63.5  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
376 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
386 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  28.33 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  35.06 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  33.98 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
367 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
325 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
408 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  34.34 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  32.47 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  37.37 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  42.2 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  34.78 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  39.05 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  27.78 
 
 
379 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
337 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
425 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.23 
 
 
423 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  23.97 
 
 
429 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  28.93 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 
394 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.53 
 
 
388 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
383 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  38.94 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.73 
 
 
375 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>