189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  100 
 
 
787 aa  1598    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
867 aa  196  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.55 
 
 
1644 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  34.55 
 
 
1644 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
545 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
873 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 
414 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  37.15 
 
 
725 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 
774 aa  168  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
3301 aa  167  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
856 aa  167  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  34.37 
 
 
671 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  34.1 
 
 
916 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
401 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
392 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
392 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
791 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 
404 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
482 aa  124  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  34.24 
 
 
383 aa  120  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
1044 aa  119  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
389 aa  118  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
480 aa  118  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
1386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
373 aa  115  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
1241 aa  97.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
1243 aa  94  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
1261 aa  94  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
1241 aa  90.9  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
679 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
1229 aa  84.7  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  21.43 
 
 
743 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
1398 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
1089 aa  80.1  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
616 aa  77.4  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
1028 aa  75.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
1915 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
359 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
374 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
357 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  25.65 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0135  hypothetical protein  26.14 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  26.27 
 
 
1219 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  39.18 
 
 
394 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  26.53 
 
 
1232 aa  64.3  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
1233 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  23.86 
 
 
1635 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
393 aa  61.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3296  WcbH  22.3 
 
 
598 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3247  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.3 
 
 
598 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3282  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.3 
 
 
598 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.741817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2300  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.64 
 
 
598 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0528  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.64 
 
 
598 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.81282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1071  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.64 
 
 
598 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2178  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.64 
 
 
598 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
406 aa  57.4  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3844  hypothetical protein  23.13 
 
 
427 aa  55.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.429225 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0749  hypothetical protein  31.2 
 
 
615 aa  54.7  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
397 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
387 aa  53.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
388 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  28.95 
 
 
365 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
765 aa  53.5  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
345 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.13 
 
 
390 aa  52.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
789 aa  52.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
414 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
385 aa  52  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1536  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
380 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.248937 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
379 aa  51.2  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  28.51 
 
 
422 aa  51.2  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
387 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  32.29 
 
 
389 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
434 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  30.07 
 
 
393 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
345 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0742  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
369 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
395 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0191  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
779 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  30.65 
 
 
415 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
395 aa  49.3  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.51 
 
 
393 aa  48.9  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
358 aa  48.9  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
379 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
358 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
380 aa  48.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  44.23 
 
 
378 aa  48.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
392 aa  47.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
415 aa  47.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
378 aa  47.8  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
748 aa  47.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
823 aa  47.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
623 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>