24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0135 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0135  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  24.11 
 
 		 743 aa  89.7  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 1261 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 1241 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 1241 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 1028 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  26.14 
 
 		 787 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 		 1089 aa  62.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  22.42 
 
 		 1243 aa  62.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 		 1229 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 1398 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  22.74 
 
 		 1915 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2178  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.79 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2300  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.79 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3282  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.79 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.741817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3247  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.79 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1071  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.79 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0528  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.79 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.81282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3296  WcbH  22.79 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341836  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 1332 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>