32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0749 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1276    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  28.33 
 
 		 1635 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  27.88 
 
 		 1219 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 1233 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 995 aa  60.1  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  30.82 
 
 		 916 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  31.2 
 
 		 787 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 344 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 1044 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3451  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 274 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 396 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  27.33 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 791 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 		 616 aa  48.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  22.46 
 
 		 376 aa  47.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.02 
 
 		 1644 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.71 
 
 		 356 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.02 
 
 		 1644 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 		 679 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  23 
 
 		 624 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  26.88 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 725 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1232 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  25 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 536 aa  44.3  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0893  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 389 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.021774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0391  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 457 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>