More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0893 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0893  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
389 aa  794    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.021774  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6405  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 
384 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.46 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.46 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1050  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.806851  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  23.78 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.81 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
535 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
850 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  22.22 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.42 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  24.83 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  24.83 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
967 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.42 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  20.77 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  28.03 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  28.75 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  26.01 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01924  hypothetical protein  21.79 
 
 
260 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
456 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  26.01 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  26.01 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
366 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.44 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
366 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  21.32 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  25.7 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
456 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  29.19 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 
434 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
383 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
393 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
860 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  27.95 
 
 
859 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.5 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
371 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  29.29 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  24.9 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13921  putative glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.69221  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
366 aa  63.5  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
435 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
435 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  26.85 
 
 
846 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
846 aa  63.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
381 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
356 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
367 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  32.23 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>