More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01937 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  100 
 
 		 370 aa  751    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01924  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01925  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.690141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  31.21 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  26.99 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 393 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  25.16 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  24.84 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  29.77 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  29.77 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  29.77 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  29.39 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  29.91 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 361 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  29.89 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.85 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.55 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.26 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 		 400 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 373 aa  92.8  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.87 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  29.61 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  29.61 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 672 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 394 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 1261 aa  89.7  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 442 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.53 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  26.27 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  25.2 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 444 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>