79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1074 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
404 aa  796    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  41.49 
 
 
392 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  41.39 
 
 
392 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  35.45 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 
401 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 
725 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  39.37 
 
 
414 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
856 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
867 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  34.87 
 
 
1644 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
373 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.87 
 
 
1644 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
774 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
3301 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
791 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  32.66 
 
 
916 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  35.2 
 
 
787 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
1386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
389 aa  129  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
873 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
671 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
1044 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
374 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
679 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
616 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
379 aa  106  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
624 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
377 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
357 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  28.12 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
359 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  29.83 
 
 
1232 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  26.05 
 
 
1219 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  32.45 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  26.12 
 
 
1635 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
1233 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  34.48 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
379 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  30.18 
 
 
523 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
360 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
383 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
355 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  27.86 
 
 
759 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
995 aa  48.9  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  28.93 
 
 
381 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
420 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.72 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  30.86 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1835  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 
550 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0998709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.03 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
348 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.69 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  31.01 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
407 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
344 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
377 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
461 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1323  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.81 
 
 
405 aa  43.1  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  27.78 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
387 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>