More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1536 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1536  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
380 aa  782    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.248937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
623 aa  83.2  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.56 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  32.6 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.59 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  23.63 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
393 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
453 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
499 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  22.57 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
498 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  22.82 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.65 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.7 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
438 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
457 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.88 
 
 
769 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.81 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  27.75 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  31.18 
 
 
650 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  26.81 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
361 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  26.67 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  22.55 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
434 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  29.08 
 
 
450 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.32 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  22.79 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  23.49 
 
 
426 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
426 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
440 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.32 
 
 
427 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
421 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  24.16 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  31.02 
 
 
480 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  22.83 
 
 
398 aa  63.2  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
386 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  27.23 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  20.22 
 
 
432 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>