274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4088 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 369 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  81.82 
 
 		 361 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  50.54 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4915  hypothetical protein  59.88 
 
 		 182 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.327888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.24 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.24 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.24 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.24 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.24 
 
 		 374 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  33.81 
 
 		 373 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.24 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.43 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.15 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  33.15 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  32.31 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  33.15 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  32.31 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.15 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  32.95 
 
 		 373 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 377 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  32.17 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  34.78 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  30.32 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  30.29 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  27.4 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.22 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  38.21 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  30.15 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.94 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 420 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.98 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.32 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.05 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.32 
 
 		 462 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 821 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.8 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 774 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 750 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 828 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>