253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4237 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 361 aa  708    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  81.82 
 
 		 369 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  50.14 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4915  hypothetical protein  59.88 
 
 		 182 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.327888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  35.05 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  35.05 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  34.65 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  35.05 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  35.05 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  34.35 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  35.05 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.8 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.8 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  34.55 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.8 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  33.8 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.23 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  31.98 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  31.09 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  32.15 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  31.92 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  32.57 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  27.8 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  31.07 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  20.99 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.63 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.43 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.83 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  35 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 819 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 828 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 821 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  37.5 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  29.09 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 408 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 822 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.44 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  28.63 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0779  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.26 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 750 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>