More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1453 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  716    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  60.42 
 
 
375 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  55.89 
 
 
342 aa  411  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  59.88 
 
 
350 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  58.31 
 
 
343 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  58.91 
 
 
372 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  57.73 
 
 
343 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  56.85 
 
 
343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  56.53 
 
 
350 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  57.7 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  55.97 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  58.01 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  56.8 
 
 
356 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  58.01 
 
 
344 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  58.91 
 
 
344 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.31 
 
 
344 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.13 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.13 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.13 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.13 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.13 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.13 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.13 
 
 
344 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  57.7 
 
 
344 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  57.7 
 
 
344 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  58.97 
 
 
521 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  54.38 
 
 
333 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  51.69 
 
 
345 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  54.85 
 
 
380 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  53.28 
 
 
365 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  52.33 
 
 
353 aa  342  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  49.17 
 
 
367 aa  342  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  50.74 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  48.03 
 
 
367 aa  335  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  54.1 
 
 
351 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
393 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  52.44 
 
 
352 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  48.53 
 
 
360 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  52.2 
 
 
354 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  55.82 
 
 
350 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  50.76 
 
 
344 aa  329  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  47.14 
 
 
354 aa  329  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  53.21 
 
 
351 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  51.81 
 
 
351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  51.08 
 
 
352 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  50.76 
 
 
355 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  53.87 
 
 
353 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  51.14 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  51.52 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  50.89 
 
 
342 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  50.46 
 
 
349 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  48.1 
 
 
351 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  53.05 
 
 
378 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  50.76 
 
 
358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  50.71 
 
 
348 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  48.96 
 
 
357 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  51.03 
 
 
345 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  49.11 
 
 
393 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  50.15 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  47.09 
 
 
363 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  46.5 
 
 
355 aa  305  8.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  51.37 
 
 
358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  51.06 
 
 
358 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  45.27 
 
 
345 aa  295  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 
368 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  49.85 
 
 
343 aa  289  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  40.24 
 
 
367 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  38.58 
 
 
393 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 
381 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  33.24 
 
 
381 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
377 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.8 
 
 
381 aa  169  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.96 
 
 
377 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.38 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
405 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
376 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  29.43 
 
 
385 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
377 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  30.87 
 
 
382 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  30.87 
 
 
382 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  29.97 
 
 
377 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
416 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 
381 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  29.02 
 
 
377 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.47 
 
 
377 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 
403 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
381 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  29.87 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
441 aa  153  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
380 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
380 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 
380 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
406 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
413 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>