More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1601 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
355 aa  730    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  48.63 
 
 
350 aa  324  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  49.7 
 
 
356 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  49.11 
 
 
350 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  49.7 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  49.7 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  47.9 
 
 
354 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  48.51 
 
 
343 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  48.17 
 
 
353 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  47.27 
 
 
333 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  47.32 
 
 
343 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  47.46 
 
 
343 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  48.26 
 
 
394 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  47.62 
 
 
344 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  46.97 
 
 
345 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  48.34 
 
 
353 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  47.32 
 
 
344 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  45.67 
 
 
351 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  47.32 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  50.15 
 
 
375 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  45.97 
 
 
351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  46.5 
 
 
356 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  47.92 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.57 
 
 
344 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  47.95 
 
 
350 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  47.32 
 
 
344 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  46.53 
 
 
360 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  48.94 
 
 
345 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  47.32 
 
 
344 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  45.53 
 
 
367 aa  299  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  44.14 
 
 
393 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  47.11 
 
 
349 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  44.98 
 
 
352 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  45.92 
 
 
351 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.27 
 
 
344 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.27 
 
 
344 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.27 
 
 
344 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  45.75 
 
 
363 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.27 
 
 
344 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
342 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.27 
 
 
344 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.27 
 
 
344 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.27 
 
 
344 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  45.54 
 
 
344 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  47.08 
 
 
345 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  44.79 
 
 
393 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  48.05 
 
 
357 aa  292  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  48.25 
 
 
368 aa  293  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 
355 aa  292  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  47.16 
 
 
355 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  45.07 
 
 
348 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  44.28 
 
 
351 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  43.77 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  49 
 
 
521 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  45.95 
 
 
342 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  44.06 
 
 
367 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  47.92 
 
 
343 aa  278  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  44.07 
 
 
349 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  44.38 
 
 
380 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  43.45 
 
 
365 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  44.64 
 
 
358 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  45.37 
 
 
358 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  46.99 
 
 
350 aa  271  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  45.07 
 
 
358 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  44.02 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  43.31 
 
 
378 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  40.53 
 
 
367 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 
403 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
404 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.22 
 
 
403 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  34.59 
 
 
393 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  36.88 
 
 
406 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 
396 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
380 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 
406 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.45 
 
 
396 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  36.88 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.44 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.44 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.13 
 
 
380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  35.13 
 
 
380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.13 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.76 
 
 
380 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.13 
 
 
380 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
373 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
406 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
416 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
400 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
405 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
377 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.57 
 
 
382 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.14 
 
 
385 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>