22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0150 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
316 aa  658    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  33.52 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
327 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
867 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
856 aa  129  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
3301 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
373 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  26.67 
 
 
527 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  25.86 
 
 
335 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  24.36 
 
 
450 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  24.76 
 
 
339 aa  96.3  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  27.84 
 
 
916 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2780  hypothetical protein  23.46 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3527  hypothetical Glycosyltransferase  26.17 
 
 
689 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1704  hypothetical Glycosyltransferase  25.39 
 
 
689 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.663936  hitchhiker  0.0000000000000460309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1551  hypothetical protein  24.02 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983382  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3366  hypothetical protein  25.56 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
1562 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0250  hypothetical protein  19.22 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0934  hypothetical protein  24.38 
 
 
573 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  22.4 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0673  putative glycosyltransferase  22.77 
 
 
327 aa  42.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.353586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>