21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2581 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  32.48 
 
 
356 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
3301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  26.74 
 
 
527 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2780  hypothetical protein  26.65 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
316 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 
856 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  23.99 
 
 
450 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
867 aa  89.7  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  30.07 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  24.85 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
1562 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3527  hypothetical Glycosyltransferase  24.18 
 
 
689 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1704  hypothetical Glycosyltransferase  24.53 
 
 
689 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.663936  hitchhiker  0.0000000000000460309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1551  hypothetical protein  22.1 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983382  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3366  hypothetical protein  22.65 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  26.55 
 
 
916 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0250  hypothetical protein  21.9 
 
 
335 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0934  hypothetical protein  20.3 
 
 
573 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>