21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0934 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0934  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1180    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1771  hypothetical protein  49.08 
 
 		 366 aa  223  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0716326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  39.68 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 1562 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3366  hypothetical protein  35 
 
 		 351 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0250  hypothetical protein  33.8 
 
 		 335 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1551  hypothetical protein  34.01 
 
 		 329 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983382  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3527  hypothetical Glycosyltransferase  30.77 
 
 		 689 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1704  hypothetical Glycosyltransferase  30.77 
 
 		 689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.663936  hitchhiker  0.0000000000000460309 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0673  putative glycosyltransferase  32.39 
 
 		 327 aa  127  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.353586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 		 3301 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  25.86 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  25.9 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 867 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  25.2 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  22.89 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 856 aa  56.2  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  20.3 
 
 		 335 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>